დეპარტამენტის საქმიანობა უნივერსიტეტის მისიას ეფუძნება და მისი ძირითადი მიზანია უნივერსიტეტის განვითარების სტრატეგიული მიმართულებების დადგენა და მათი განხორციელების გზების განსაზღვრა, უნივერსიტეტის პერსონალის რეგულარული გადამზადება სამედიცინო განათლებისა და მართვის თანამედროვე მეთოდოლოგიაში.
ზემოხსენებულიდან გამომდინარე, დეპარტამენტის ფუნქციებია:
- თსსუ-ის განვითარების გრძელვადიანი (შვიდწლიანი) სტრატეგიული გეგმის შემუშავება უნივერსიტეტის ყველა სტრუქტურასთან და დაინტერესებულ მხარსთან თანამშრომლობით;
- უნივერსიტეტის განვითარების სამწლიანი სამოქმედო გეგმის შემუშავება;
- სტრატეგიული და სამოქმედო გეგმების განხორციელების რეგულარული მონიტორინგის პროცესში მონაწილეობა;
- უნივერსიტეტში მოქმედი საგანმანათლებლო პროგრამების მოდერნიზაციის ხელშეწყობა; ქვეყნისა და საერთაშორისო მოთხოვნების შესაბამისად სასწავლო პროცესის მოდერნიზაცია - ახალი მეთოდების და ტექნოლოგიების შემოღების ინიციატივა; სწავლის, სწავლების და შეფასების თანამედროვე მეთოდოლოგიის დანერგვა.
- სტრატეგიული გეგმის განხორციელების საკითხებზე საფუძველზე ფაკულტეტებისა და სხვა სტრუქტურული ერთეულებისთვის კონსულტაციების გაწევა;
- სამედიცინო განათლების დიპლომამდელი, დიპლომისშემდგომი და უწყვეტი პროფესიული განვითარების პროგრამების საერთაშორისო აკრედიტაციის პროცესის ხელშეწყობა;
- აკადემიური და ადმინისტრაციული პერსონალისთვის ტრენინგების ორგანიზება სამედიცინო განათლების მეთოდოლოგიაში და უნივერსიტეტის მართვაში;
- უნივერსიტეტისათვის სტრატეგიული პარტნიორებისა და ფონდების მოძიება, მათთან ურთიერთობის დამყარება;
- უნივერსიტეტის სტრატეგიულ პარტნიორებთან თანამშრომლობით ერთობლივი საგანმანათლებლო პროექტების შემუშავება და განხორციელება;
- თსსუ–ს ბაზაზე საერთაშორისო კონფერენციების და სემინარების მოწყობა წამყვანი უცხოელი და ქართველი ექსპერტების მონაწილეობით;
- სამედიცინო განათლების საკითხებზე საერთაშორისო ფორუმებში მონაწილეობა