თბილისის სახელმწიფო სამედიცინო უნივერსიტეტი სრულუფლებიანი წევრია შემდეგი საერთაშორისო ორგანიზაციებისა და ასოციაციების:
- ევროპის უნივერსიტეტთა ასოციაცია EUA
- სამედიცინო განათლების საერთაშორისო ასოციაცია AMEE
- უნივერსიტეტთა დიდი ქარტია Magna Charta Universitatum
- უნივერსიტეტთა პრეზიდენტების საერთაშორისო ასოციაცია IAUP
- ევროპის მედიკოს სტუდენტთა ასოციაცია EMSA
- მედიკოს სტუდენტთა ასოციაციების საერთაშორისო ფედერაცია IFMSA
- ევრაზიული აბრეშუმის გზის უნივერსიტეტების კონსორციუმი ESRUC
- სქესობრივი და რეპროდუქციული ჯანმრთელობისა და უფლებების აკადემიური ქსელი ANSER
- ევროპის სამედიცინო სკოლათა ასოციაცია (AMSE)
თბილისის სახელმწიფო სამედიცინო უნივერსიტეტი მჭიდროდ თანამშრომლობს შემდეგ ორგანიზაციებთან:
- ჯანდაცვის მსოფლიო ორგანიზაცია - WHO
- სამედიცინო განათლების მსოფლიო ფედერაცია - WFME
- უცხოელ სამედიცინო კურსდამთავრებულთა საგანმანათლებლო კომისია - ECFMG
- ოქსფორდის აკადემიური კავშირი (ACADEMIC UNION OXFORD)
- გერმანიის აკადემიური გაცვლის სამსახური - DAAD
- ამერიკის შეერთებული შტატების საერთაშორისო განვითარების სააგენტო - USAID
- გაერთიანებული ერების ორგანიზაციის მოსახლეობის ფონდი (UNFPA)
- ქირურგთა, გასტროენტეროლოგთა და ონკოლოგთა საერთაშორისო ასოციაცია - IASGO
- ამერიკულ-ავსტრიული ფონდი/ღია სამედიცინო ინსტიტუტი - AAF/OMI
- დაავადებათა კონტროლის ცენტრები (CDC)
- ჯანდაცვის სკოლების ასოციაცია ევროპის რეგიონში (ASPHER)
- ევროპის უმაღლესი განათლების საერთაშორისო ასოციაციის (EAIE)